★「Geno2.0」と「23andMe」では、どちらが優れているか?(2014.7.15)

はじめて、祖先探査目的で遺伝子検査を行う場合、どの遺伝子解析会社を利用するか迷うことだと思う。

日本国内の解析会社は論外(Y染色体の解析が出来ない。mtDNAの解析が旧式で中途半端な結果しか出ないのに検査費用だけは高額)として、私のように海外数社に申込をして実際に試してみた結果、「Geno2.0」で「23andMe」と異なる結果が出た例もある。「Geno2.0」のFAQには次のようなことが書かれている。


(自動翻訳)
私は私のDNAがAncestry.comと23andMeはのような他の遺伝子検査の部位を介してテストし持っていた。どのように私のジェノグラフィック?プロジェクトの結果は彼らのものとは異なり、なぜですか？ ジェノグラフィック?プロジェクトは、参加キットを通じて人の移動の新しいパターンだけでなく、公共の検査を解明するために私たちの科学的なチームによって行わ作品を網羅ナショナルジオグラフィック協会の研究プロジェクトである。

当社のテストでは、人類学的な視点から深い祖先に焦点を当てています。あなたはあなたが私たちのストーリーセ??クションの他の参加者にどのように関連しているか見てのオプションを持っているが、それは、そのようなAncestry.comによって提供されるように、主に系譜のテストサービスではありません。23andMeは、疾患のリスクと関連しているマーカーを調べる、主に医学的に焦点を当てた検査会社です。彼らは祖先にいくつかの洞察を提供していないが、それは彼らの主要な焦点ではありません。

私たちは私たちのテストに使用遺伝的技術は、他のテストで使用できる数よりはるかに多くのY染色体とミトコンドリアDNAマーカーで、祖先の研究のために最適化されたカスタム設計ジェノタイピングチップです。私たちの常染色体マーカーは、同様にむしろ医療検査よりも、祖先を推論するために最適化されており、我々はそれが、この目的のために利用可能な最高の技術であることを感じています。


(原文)
I’ve had my DNA tested through other genetic testing sites like Ancestry.com and 23andMe. How do my Genographic Project results differ from theirs, and why? The Genographic Project is a research project of the National Geographic Society, which encompasses work carried out by our scientific team to elucidate new patterns of human migration, as well as public testing through the participation kits. Our testing focuses on deep ancestry from an anthropological perspective. It is not primarily a genealogy testing service, such as that offered by Ancestry.com, although you do have the option of seeing how you are related to other participants in the Our Story section. 23andMe is primarily a medically focused testing company, examining markers that are associated with disease risk. While they do offer some insights into ancestry, that is not their primary focus. The genetic technology we use for our testing is a custom-designed genotyping chip optimized for the study of ancestry, with far more Y-chromosome and mtDNA markers than are available with any other test. Our autosomal markers are similarly optimized for inferring ancestry, rather than medical testing, and we feel that it is the best technology available for this purpose.


…という訳で、要するに「23andMeは、祖先解析に関してはいいかげんなのである」と述べられている通り、Y染色体のハプログループに関しても、主にSTR(ショート・タンデム・リピート)を利用しているので、時折間違いを起こすのである。

また、「23andMe」で、有名人のハプログループとして取り上げられている表記が古く、かつマーカー名(ターミナルSNP)を記載していないし、例えば、日本人にとって重要な枝である、Y染色体のハプログループの「D-M64.1」なども「D1b」ではなく今だに「D2」と古い表記のままで、改定される気配が無いのである。よって「23andMe」の結果は著しく信頼性に欠けると言わざるを得ない。さすが、FTAから停止を食らっただけある怠慢ぶりなのである。

現時点で、ベストと言える祖系解析の方法は、(1)「Geno2.0」で検査。→(2)「FTDNA」に転送。→(3)「FTDNA」でSTRを検査。→(4)「FTDNA」で気になるSNPがあれば検査。→(5)より詳しく検査がしたければ「FTDNA」の「Big-Y」で検査。の順が最も妥当だと思えるのである。

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