レイ・バンクス氏からのBAMファイル利用に関してのmail(2014.8.8)

(詳しくはFTDNAへ)

★レイ・バンクス氏からのBAMファイル利用に関してのmail(2014.8.8)

先月7月20日にレイ・バンクス氏からBig-yの結果に関して、再び興味深いmailが来ておりましたが、すっかり見落としておりました(^^；

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Hello XXXXXX,
やあ、 XXXXXX,

This is Ray Banks who analyzed your Big Y results.

私はあなたのビッグY結果を分析したレイ・バンクスです。

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I administrator of your haplogroup D Project and the content expert for haplogroup D at ISOGG XXXXX and I am co-author of a major new Y DNA tree study XXXXX Since December I have submitted almost 7000 shared mutations I have identified to various Y trees at ISOGG.

私あなたの属する「ハプログループDプロジェクト」とISOGGでの「ハプログループD」の専門管理者です。私は12月以来、約7000のISOGGの主要な新しいさまざまなY-DNA系統樹を研究し、変異を特定してきました。(若干意訳です。要するに自己紹介が述べられています)

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The data from the Big Y testing has allowed me to add a number of new subbranches to the D tree, and we have dozens of other promising newly discovered items being tested individually.

Big Yテストのデータのお蔭でDツリーにたくさんの派生を加えることができました。そしてこれから個別にテストされるであろう新しい発見が幾つもありました。

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I’ve recently installed software on my computer that will allow me in the future to look up your results for any of the 20 million positions on the Y chromosome using your raw data file. The lab only reported to you abt 20,000 sites where you had a mutation present or others reported one in the past.

最近とあるソフトウェアをインストールしたのですが、それは生データを使用しているY染色体2千万の位置結果を調べるのに将来役立つことでしょう。ラボはあなたに2万のサイトを報告しただけにすぎません。（そのサイトではあなたが現在、突然変異を持っていることや過去に他の誰かがその突然変異を持っていたことが示されている）

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But it will happen in the future that when someone else in your subgroup tests that we will want to know whether you have a clear negative or instead just a no read for new mutations found in him.

しかし、あなたのサブグループの中の誰かがテストする時に、あなたが明らかに陰性なのかもしくはその人に新たな突然変異が見受けられないだけなのかどっちなのかを知りたい時が訪れるでしょう。

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Having your raw data available will allow easy look up without having to ask you to test for the item under consideration.

あなたの生データを提供してもらえればそれが容易に調べられます。

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I would also like to look up your results now for some items discovered in others in your subgroup.

あなたのサブグループに属する他の人たちに見受けられた事象の結果も調べたいのです。

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If you would be willing to share your raw data through what is called the BAM file, there are two approaches:

BAMファイルというものを通してあなたの生データを共有してくれるのであれば、以下の2つの方法があります。

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1. If you have already asked Family Tree DNA to make your BAM file available, please share with me the address of the link.

1.既にFamily Tree DNAにBAMファイルを依頼しているのであればリンクのアドレスを教えてください。

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2. If you have never asked Family Tree DNA, send a one-sentence e-mail to helpdesk@familytreedna.com and ask that they send you a link to your Big Y BAM file, providing them your kit # XXXXXXXXX.

2.もしFamily Tree DNAにそれをまだ依頼していないのであれば、ヘルプデスク宛に一言メッセージと(キットナンバー)を送ってください。そうすればあなたのBig Y BAMファイルへのリンクが送られてきます。

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Then when they provide this, just let me know what the link address is so I can download the file.

そのリンクを入手したら、今度は私にそのリンクアドレスを教えてください。ダウンロードするので。

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Thanks so much for being part of our history-making research discovering the migrations of our ancestors through info on branching of the G tree.

ご協力どうかよろしくお願いします。

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Ray Banks
レイ・バンクス　拝

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ざっと訳すと以上のような内容でした。

要するにFTDNAは、Big-Y利用者に対して任意(希望者のみ)でBAMファイルという約1ギガバイトほどする、生データのさらに基になったデータを開放しているので、その利用の許可を求めてきたようなのでした。

Big-Y利用者は、FTDNAのサイトにログインすれば自分のBig-Yの結果が見れますし、横に「ダウンロード」の項目があるので、それをクリックすれば、生データを「ダウンロード」出来るのでありますが、このBAMファイルというのは、それの基となっている更に重たいデータで専門的すぎるので、希望者にしか開放してないらしい(ただし希望すれば無料で見れる)のです。

…という訳で、FTDNAのサイトに「BAMファイル」を観たい旨の申請を送ることにしました。

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